基因分析论文发表

2000年：1. 何光华、裴炎、杨光伟、谢戎．2000．我国中籼杂交稻亲本的DNA变异性研究．作物学报，26（4）：449-4542. 何光华、裴炎、杨光伟、唐梅、谢戎、侯磊、杨正林、李永洪．2000．野败型杂交稻恢复基因的AFLP标记研究．遗传学报，27（4）：304-3103. 何光华、唐梅、裴炎、杨光伟、郑家奎、候磊．2000．汕优63杂合性的RAPD和AFLP分析．中国水稻科学，14（3）：177-1784. 何光华、朱发云、裴炎、杨光伟、谢戎、杨正林、李永洪．2000．利用极大似然法分析恢复基因的遗传．西南农业学报，13（2）：14-185. 唐梅、裴炎、何光华．2000．四川省主要保持系的随机扩增多态性研究．西南农业学报，13（1）：12-166. 侯磊、杨光伟、何光华、唐彬、肖月华、裴炎．2000．水稻雄性不育系珍汕97A及其保持系叶绿体的AFLP分析．植物学报，42(6)：591-5947. 谢戎、余金洪、何光华、杨正林、骆强．2000．籼型光敏不育系1103S的春繁技术研究．湖北农学院学报，20（2）：100-1038. 谢戎、余金洪、何光华、吴丽君．2000．旱育秧在光温敏不育系1103S就地春繁中的应用效果．杂交水稻，15（4）：10-119. 谢戎、何光华、杨正林、王贵雄、金良．2000．INGER观察圃稻种资源在泸州的观察与利用．绵阳经济技术高等专科学校学报，17（1）：6-810. 唐梅、周仕春、何光华、裴炎．2000．水稻杂种优势利用的现状、问题与对策．乐山师范学院学报，（3）：51-532001年：1. 李永洪、何光华、谢戎、杨正林、王洪明．2001．水稻早恢402体细胞培养初步研究．西南农业大学学报，23（2）：134-1352. 唐梅、何光华、裴炎、杨光伟．2001．DNA分子标记在作物杂种优势研究中的应用．杂交水稻，16（6）：1-53. 谢戎、邵继荣、孙敬三、何光华、弓加文．2001．水稻温敏叶片间断失绿过程中的氨基酸组分变化．乐山师范学院学报，(4) ：28-304. 李永洪、李天炬、谢戎、何光华、杨正林．2001．两系杂交稻泸光2S/130的干物质生产特性研究．绵阳经济技术高等专科学校学报，18（1）：1-35. 谢戎、金良、李永洪、何光华、杨正林．2001．黑紫稻资源农艺性状的因子分析．绵阳经济技术高等专科学校学报，（4）2002年：1. 何光华、侯磊，李德谋，罗小英，牛国清，唐梅，裴炎．2002．利用分子标记预测杂交水稻产量及其构成因素．遗传学报，29（5）：438-4442. 何光华，王文明，刘国庆，侯磊，肖月华，唐梅，杨正林，裴炎．2002．利用SSR标记定位明恢63的2对恢复基因．遗传学报，29（9）：798~8023. 唐梅、何光华、裴炎．2002．中籼杂交水稻亲本多态性的AFLP分析．遗传，24（4）：439-4414. 谢戎、何光华、黄富、李耘、吴丽君、李永红．2002．水稻体细胞无性系粒形指标因子分析．湖北农学院学报，22（6）：481-4855. 唐梅、何光华、裴炎、杨光伟．2002．中籼杂交稻遗传多样性的RAPD分析．西南农业学报，（3）6. 谢戎、李永红、何光华、杨正林．2002．水稻早恢402体培后代及测交F1主要性状的变异分布．广西农业生物科学，21（4）：234-2377. 谢戎、何光华、等．2002．水稻早熟恢复系体细胞无性系测交F1聚类分析．西南农业大学学报，24（5）：393-3952003年：1. Guanghua He、Lei Hou、Yuehua Xiao、Xiaoying Luo、Guoqing Niu、Guangwei Yang、Yan Pei．2003．A Common Sequence Difference between Cytoplasmic Male Sterile Lines And Their Maintainer Lines Existing in Rice (Oryza sativa L) Chloroplast tRNA-Leu Gene Region．Euphytica，131（3）：269-2742. 桑贤春、何光华*、张毅、杨正林、裴炎．2003．水稻PCR扩增模板的快速简易制备．遗传，25（6）：705-7073. 谢戎、何光华、黄富、吴丽君、李永红、金良．2003．水稻早恢402体培株系产量与种子及米质性状的典型相关．西南农业学报，16（3）：18-212004年：1. 谢戎、李耘、何光华*、黄富、杨正林、张毅、吴丽君．2004．杂交水稻干物质累积的基因型差异．西南农业大学学报，26（4）：379-3822. 李耘、谢戎、何光华*、黄富、杨正林、张毅、吴丽君．2004．杂交水稻不同生育期各器官干物质累积的遗传效应．西南农业大学学报，26（5）：538-5423. 张毅、杨光伟*、何光华*、沈福成、张正圣、杨正林．2004．水稻芽鞘紫线抑制与反抑制的遗传分析及反抑制基因的SSR定位．遗传学报，31（8）：830-8354. 张毅、何光华*、杨光伟*、向娟、沈福成、杨正林．2004．水稻长穗颈性状的一种新的遗传行为的发现与分析．中国水稻科学，18（3）：213-2175. 罗洪发、钟秉强、杨正林、李云锋、何光华*．2004．水稻花粉管通道法导入高粱DNA的分子验证．分子植物育种，2（4）：501-5056. 李云峰、罗洪发、杨正林、钟秉强、何光华*．2004．水稻雄蕊雌蕊化突变体的遗传分析．中国水稻科学，18（6）：499-5027. 钟秉强、杨正林、何光华*．2004．33份美国稻品种的恢复和保持能力分析．西南农业大学学报，26（5）：554-5558. 李云峰、钟秉强、杨正林、何光华*．2004．中国稻与美国稻的SSR标记多态性分析．分子植物育种，2（6）：801-8069. 陶澜、程艳军、谢戎、何光华、杨正林、张毅．2004．水稻穗颈维管束及其相关性状的遗传效应分析．中国农业科学，37（12）：1932-19372005年：1. 钟秉强、杨正林、冉启亮、何光华*．2005．美国水稻品种农艺性状和品质性状的温度钝感特性研究．中国农学通报，21（2）：118-1212. 罗洪发、杨正林、钟秉强、李云锋、何光华*．2005．外源DNA导入水稻稳定后代SSR分子水平上的分类．中国农学通报，21（7）：28-303. 张毅、沈福成、杨正林、谢戎、钟秉强、谭自俊，何光华*．2005．水稻籽粒簇生材料Z1820簇生性的遗传分析．中国农学通报，21（7）：64-654. 肖向文、李平、杨正林、钟秉强、侯磊、李德谋，何光华*．2005．5个骨干籼型恢复系再生能力的比较研究．西南农业大学学报，27（3）：378-3812006年：1. Luo Hongfa，Li Yunfeng，Yang Zhenglin，Zhong Bingqiang，Xie Rong，Ren Maozhi，Luo Da，He Guanghua*．2006．Mapping of a pistilloid-stamen (PS) gene on the short arm of chromosome 1 in rice．Genome，49（8）：1016-10222. Sang Xianchun，Yang Zhenglin，Zhong Bingqiang，Li Yunfeng，Hou Lei，Pei Yan，Li Guanrong & He Guanghua* ．2006．Assessment of Purity of Rice CMS Lines Using cpDNA Marker．Euphytica，152(2):177-1833. Feng Li，Ren Maozhi*，Luo Da，Luo Hongfa，He Guanghua* ．2006．Isolation of full-length cDNA and promoter of target gene from plant by rapid identification of transcriptional initiation site (RITIS)．Molecular Plant Breeding ，4（1）：23-284. 张毅，李云峰，谢戎，杨正林，钟秉强，沈福成，谭自俊，何光华*．2006．水稻小穗簇生性近等基因系的构建及其近等性评价．作物学报，32（3）：397-4012007年：1. Xianchun Sang, Zhenglin Yang, Bingqiang Zhong, Lei Hou, Demou Li, Yan Pei, Guanghua He *．2007．Using cpDNA and SSR combinations to identify seed purity of rice sporophytic cytoplasmic male sterile lines．Rice Genetics Newsletter，23:29-322. 查仁明，杨正林，赵芳明，钟秉强，彭涛，谢戎，何光华*．2007．不同时期水稻主要恢复系、不育系的遗传差异变化研究．作物学报，33(4):573-5783. 王秋实，何光华*．2007．水稻抗稻瘟病遗传资源与野败型骨干恢复系间的遗传差异研究．分子植物育种，5(1):74-784. 王楠，赵芳明，凌英华，钟秉强，杨正林，李云峰，杨国华，何光华*．2007．一个水稻披叶突变体的遗传分析和基因定位．分子植物育种，5(1):54-582012年：桑贤春副教授和李云峰副教授的“一个禾本科特异的MADS-box基因CFO1调控水稻花器官特征，CHIMERIC FLORAL ORGANS 1, Encoding a Monocot-specific MADS-box Protein, Regulates Floral Organ Identity in Rice”论文发表在《Plant physiology》（if=6.5，2011）（2012，160（2）：788-807），论文的通讯作者为何光华教授。博士生方立魁和赵芳明副教授的“一个2OG-Fe (II) 加氧酶基因RL14，通过影响次生壁的合成调控水稻叶片的卷曲，Rolling-leaf14 is a 2OG-Fe (II) oxygenase family protein that modulates rice leaf rolling by affecting secondary cell wall formation in leaves” 论文发表在《Plant Biotechnology Journal》（if=5.4，2011）（2012，10：524-532），论文的通讯作者为何光华教授。

基因是DNA分子上的一个功能片段，是遗传信息的基本单位，是决定一切生物物种最基本的因子;下面是我整理了基因检测技术论文，有兴趣的亲可以来阅读一下!

病毒基因的检测

【关键词】病毒基因检测

一乙型肝炎病毒DNA(HBV-DNA)测定

乙型肝炎是由乙肝病毒引起的以肝脏损害为主要临床特征的急、慢性传染病，严重者可发展成慢性肝炎、肝硬化和肝癌。在我国，乙肝是危害人类健康的一种主要传染病。

【参考值】

阴性 (Taqman荧光定量PCR技术)

【临床意义】

1.HBV-DNA是乙型肝炎病毒感染的直接证据，是HBV有活性复制能力及具传染性的确切标志。

2.可定量检测HBV-DNA含量，为临床病情判断、疗效观察提供信息。

3.HBV-DNA的出现先于其他血清学指标(如HBsAg)，可早期诊断HBV感染。

4.正常人HBV-DNA为阴性。当HBV-DNA为101～104拷贝/ml时，表明病毒复制水平低，传染性较弱;而当 HBV-DNA>104拷贝/ml时，表明病毒复制水平高，传染性强。

5.HBV-DNA含量测定可为临床药物选择提供依据。

【注意事项】

1.标本可用血清或血浆，避免肝素抗凝，避免反复冻融。

2.标本室温放置不超过4小时。

3.溶血、高胆红素标本影响检测结果。

二其他病毒DNA测定

(一)人乳头瘤病毒DNA(HPV-DNA)检查

人乳头瘤病毒是一种小的双链DNA病毒，根据核酸相关性分型已发现70余型。该病毒可以感染人的皮肤和黏摸上皮细胞，诱发细胞增生，产生乳头瘤样病变。

【参考值】

阴性 (多重核酸荧光定量PCR技术)

【临床意义】

1.HPV难以用传统的病毒培养及血清学技术检测，目前主要采用分子生物技术检测HPV-DNA，灵敏度高。

2.可对尿道、阴道、宫颈脱落细胞进行人乳头瘤病毒的检测及分型，判断体内HPV感染状况。

3.HPV 6和11型与尖锐湿疣、喉头鳞状上皮乳头状瘤发生有关;HPV 16、18、31、32型等与宫颈癌发生相关。因此，可用于对HPV高危亚型的诊断，对尖锐湿疣、宫颈癌等疾病的诊断与筛查具有重要意义。

4.HPV-DNA检测可用于考核疗效与预后。

【注意事项】

1.用无菌拭子取尿道、阴道、宫颈分泌物于无菌试管或无菌瓶中。

2.标本采集应严格按无菌操作，避免污染。并及时送检。

(二)人类巨细胞病毒DNA(HCMV-DNA)检查

HCMV是疱疹病毒科成员，人类普遍易感，多为隐性或潜伏感染。在免疫功能低下、缺陷或抑制情况下，可发生成人HCMV感染，常呈弥漫性病变，严重者甚至死亡。

【参考值】

阴性 (荧光探针杂交PCR技术)

【临床意义】

1.用于临床HCMV感染的快速诊断。

2.用于临床免疫抑制治疗过程中体内HCMV感染的快速诊断与疗效监测。获得性免疫缺陷综合征等患者HCMV感染的诊断与疗效监测。

3.PCR技术检测HCMV的敏感性高，且HCMV-DNA的出现早于临床症状或血清学标记物的出现，可早期诊断 HCMV感染。

4.妊娠早期感染HCMV可引起胎儿先天畸形，产前检测HCMV-DNA有利于优生优育。

5.连续监测巨细胞病毒的含量变化可了解病毒的复制状况，从而为疾病的早期诊断与药物疗效提供直接的病原学依据。

【注意事项】

采用EDTA抗凝全血或脑脊液标本，采集后及时送检。

(三)单纯疱疹病毒DNA(simplex herpes virus， HSV-DNA)

单纯疱疹病毒是一种有囊膜的双股DNA病毒，分为I型和II型。近年来，HSV是性传播疾病、病毒性脑炎等疾病的重要病原体。

【参考值】

阴性 (荧光探针PCR技术)

【临床意义】

1.用于检测人血清样本或体液样本中的单纯疱疹病毒并可同时分型，辅助诊断HSV感染性疾病。

2.HSV I型感染主要引起口唇疱疹、疱疹性结膜炎、脑炎和皮肤性疱疹，HSV II型主要引起生殖器疱疹， HSV-DNA检测可辅助诊断上述疾病，并可用于考核疗效与预后。【注意事项】

1.血清用无菌注射针头抽取静脉血2ml于无菌肝功管中。

2.分泌物用无菌棉拭子采集标本，女性取宫颈或阴道分泌物，男性取精液或前列腺液，将取样后的棉拭子放入无菌试管或无菌瓶中。

3.脑脊液抽取脑脊液于无菌玻璃瓶中。

(四)EB病毒DNA(EB virus，EBV-DNA)

EBV属于丫疱疹病毒科，主要经涎液传播，PCR技术可灵敏地检测出标本中的EBV-DNA，满足临床诊断、治疗需要。

【参考值】

阴性 (荧光探针杂交PCR技术)

【临床意义】

1.可快速检测血液、脑脊液、组织、尿液中的EB病毒，为EB病毒感染提供直接证据。

2.EB病毒临床上与鼻咽癌传染性单核细胞增多症、霍奇金病等的发病密切相关。

【注意事项】

1.检测标本可采用EDTA抗凝全血、脑脊液、咽拭子、尿液、病变组织等。

2.标本采集时严格按无菌操作，并及时送检。

三 RNA病毒测定

丙型肝炎病毒RNA(HCV-RNA)检测

丙型肝炎病毒是一种单链正股RNA病毒，引起丙型病毒性肝炎。丙型病毒性肝炎多因输血或血制品而引起，在输血者中还存在无症状的HCV携带者。

【参考值】

阴性(RT-PCR，荧光定量PCR技术)

【临床意义】

1.有助于HCV感染的早期诊断。

2.HCV-RNA阳性提示HCV复制活跃，传染性强。

3.HCV-RNA转阴提示HCV复制受抑，预后较好。

4.连续观察HCV-RNA，结合抗-HCV的动态变化，可作为丙肝的预后判断和干扰素等药物疗效的评价指标。

【注意事项】

1.标本可用血清或血浆，用无菌注射针头抽取静脉血2～3ml于无菌肝功管或EDTA抗凝管中送检。避免肝素抗凝，避免反复冻融。

2.标本室温放置不超过4小时。

3.溶血、高胆红素标本影响检测结果。

参考文献

[1]杨振,祁自柏,李河民.病毒基因检测技术的发展趋势. 《中国生物制品学杂志》,2006年01期.

[2]徐丽.利用基因工程进行PHB相关基因的克隆和烟草转化[D].山东师范大学,2000年.

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基因家族分析投稿期刊

转自：

近日，洛阳师范学院植物多样性保护课题组联合菲沙基因在国际主流期刊 Molecular Ecology Resources （IF=7.09，中科院一区）上发表了题为“ The chromosome-scale genome assembly,annotation and evolution of Rhododendron henanense subsp. lingbaoense ”的研究论文。该研究通过PacBio+Hi-C技术首次构建了我国特有杜鹃种-灵宝杜鹃的高质量参考基因组，随后基于比较基因组分析揭示了灵宝杜鹃与其它杜鹃间的共线性，同时也初步揭示了灵宝杜鹃逆境适应性的分子机制，从而为灵宝杜鹃的种质资源保护与进化研究提供了新见解。

杜鹃花具有较高的观赏、园艺与药用价值，近期也有大量关于杜鹃花属的基因组与转录组研究报道，这些报道对于杜鹃花属基因家族的进化和广泛的表型可塑性研究具有重要意义。但到目前为止，我国特有杜鹃种-灵宝杜鹃的基因组尚未有报道，这限制了对其遗传资源、环境适应性及分子进化的研究，因此构建灵宝杜鹃基因组具有重要理论意义。

材料：灵宝杜鹃（ Rhododendron henanense subsp. lingbaoense）测序策略：PacBio（220×）+Hi-C（100×）+Illumina（90×）

通过Survey分析，预估灵宝杜鹃基因组大小为654.12Mb，杂合为0.72%。随后研究者利用高深度的PacBio测序和Hi-C辅助组装，构建了高质量的染色体水平灵宝杜鹃基因组，其基因组大小为 622.72Mb，Contig N50=2.54Mb，Scaffold N50=50.18Mb 。接着，研究者通过多种方法证实了基因组组装的完整性与准确性，三代数据的比对率为97.85%，BUSCO评估基因组完整性为97%，二代数据检测基因组单碱基错误率仅为0.0003%；且与已发表的其它杜鹃属物种相比，本研究组装的基因组完整性和准确性都是最好的。

结合从头注释、同源注释和全长转录组注释，研究者在灵宝杜鹃种鉴定到 31098 个蛋白编码基因，平均每个基因的长度为 6393.37 bp ，其中88.77%的基因都可以得到功能注释。灵宝杜鹃基因组中65.76%的序列都是重复序列，其中LTR的含量最高。此外，研究者在灵宝杜鹃中还鉴定到 2251个rRNAs、448个tRNAs、488个snRNAs 以及94个miRNAs。

研究者选取14个近缘物种用于灵宝杜鹃的比较基因组分析，共鉴定到15483个基因家族，其中168个是灵宝杜鹃特有的基因家族。系统进化树分析表明，杜鹃属内的亲缘关系较为密切，其分化时间大致在12.3 ~ 19.9百万年前，而猕猴桃、山茶属与杜鹃属的分化时间大致在64.6~73.8百万年前。

共线性分析表明，马缨杜鹃（ Rhododendron delavayi ）、圆叶杜鹃（ Rhododendron williamsianum ）、杜鹃（ Rhododendron simsii ）与灵宝杜鹃间的共线性非常好，且以单染色体与单染色体间的共线性为主，但不同杜鹃的基因组间也存在染色体重排事件。通过WGD分析，检测到杜鹃属和山茶属有一个相似的WGD峰（Ks值在0.637到0.715），结合分子时钟，研究者确定了杜鹃属植物先发生一次WGD事件（79.2百万年前），而后与近缘种山茶属产生了分化。基因扩增收缩分析表明，灵宝杜鹃中有2257个基因家族发生了扩张，扩张基因显著富集在与对水杨酸的响应、细胞对酸化学的响应、防御反应的调节、应激反应的调节相关的通路中，这证实了灵宝杜鹃对逆境有着极强的抗性；收缩的基因则显著富集在与萜合酶活性、碳氧裂解酶活性和ADP结合相关的通路中。

之前研究表明， MYB的同源基因调控植物发育、花朵颜色和胁迫反应中发挥重要作用，研究者随后鉴定了灵宝杜鹃中MYB基因家族的变化。结果表明，灵宝杜鹃中存在110个MYB的同源基因，在13条染色体上都有分布，其MYB基因的数目要小于棉花、油菜等物种，且灵宝杜鹃中部分MYB基因存在串联重复事件。此外，基于MYB基因构建的系统进化树表明，灵宝杜鹃的MYB基因与拟南芥中的MYB基因属于不同的分类。这些结果将有助于后续MYB基因的功能验证工作。

总结

本研究通过PacBio和Hi-C技术构建了染色体水平的灵宝杜鹃基因组，在此基础上通过与其它杜鹃植物及近缘植物进行比较分析，阐述了灵宝杜鹃的基因组进化、WGD事件、与逆境适应性相关基因的扩张与分类，从而为灵宝杜鹃种质资源保护、新品种选育及遗传进化研究提供了新见解。

水稻OsMKK基因家族的结构和表达分析OsMKK是水稻MAPK途径中位于中游的一个分裂原蛋白激酶激酶基因家族,主要承载着上游信号的汇聚、逐步向下扩散传递的作用。它们在水稻生长发育和逆境反应中的功能目前还不很清楚。干旱、低温、盐害等非生物逆境是影响水稻产量的重要因素。本文对OsMKK基因家族的结构进行了生物信息学分析,预测了其可能的生物学功能。并以籼稻品种9311为材料,在低温、高温、盐害、H2O2、ABA、JA、SA下胁迫水稻幼苗。测定了水稻苗期在7种处理下生理指标的变化和OsMKK基因家族的表达模式。最后,讨论了它们可能的生物学功能。主要实验结果如下： 1.OsMKK染色体定位、进化树和基因结构分析表明,OsMKK基因家族的8成员位于4条不同染色体上,分为2大类,A、B、C、D 4个亚组。第一大类有3个基因：OsMKK1、OsMKK6、OsMKK3,含有多个内含子和外显子,其调控形式多样。第二个大类包括5个基因：OsMKK4、OsMKK5、OsMKK10-1、OsMKK10-2、OsMKK10-3,仅仅含有一个外显子。OsMKK的sub-domain和motif分析表明,该基因家族都含有11个sub-domain、ATP结合位点,磷酸化位点。除OsMKK10-1, OsMKK10-2和OsMKK10-3外,均含有S/T XXXXX S/T motif. 2.对OsMKK基因家族5’端ATG上游1.0 kb区域启动子顺式作用元件的预测,鉴定了有多个特殊的顺式作用元件。如低温响应元件、热激响应元件、脱水响应元件、ABA响应元件、JA响应元件、防卫反应响应元件。每个基因均含多个不同的顺式作用元件,可能与多个逆境反应相关。 3.7种处理对水稻苗期叶片的生理指标变化结果表明,相对电导率、丙二醛和脯氨酸含量的变化趋势比较吻合。随胁迫时间的延长,相对电导率增大(除ABA处理外)；丙二醛含量都不同程度地增加；脯氨酸含量也呈递增趋势(除JA处理外)。说明水稻幼苗随着胁迫时间的延长,其细胞受胁迫的伤害程度越大。 4.OsMKK基因家族在12℃低温、38℃高温、250 mM盐、10mMH2O2、50μM ABA,50μM JA、1 mM SA胁迫下表达具有明显的诱导特性。12℃低温处理下,OsMKK4在0-12 h表达没有变化,在24 h诱导表达；38℃高温下,OsMKK3在3 h时激活表达,随后下降。OsMKK4、OsMKK5、OsMKK6在6 h表达最强,随后下降。其它基因的表达在6 h时都略有上升；250 mM盐处理下,OsMKK3在1h瞬间诱导表达,表达量达最高值；10 mM H2O2处理下,OsMKK4、OsMKK5、OsMKK10-2在1h内就瞬间诱导表达,表达量达最高,随后下降；50μM ABA处理下,OsMKK4、OsMKK5在1h时诱导表达；50μM JA处理下,OsMKK4诱导表达最强,随着时间增加而增强。其次是OsMKK5,在1 h瞬时表达增加,而后不再增加；1mMSA处理下,OsMKK6在6h内受到诱导表达,表达量达最高值。各种逆境对其它基因表达的影响较小。 5.OsMKK在水稻茎、叶、叶鞘、幼穗的表达有一定差异。OsMKK1在茎中表达低,其他基因在4个组织中均表达。OsMKK10-2在4个组织中表达量均不高,其它基因在4个组织中均有高有低。

基因家族分析投稿期刊快

BZR（BRASSINAZOLE-RESISTANT）家族基因是编码参与油菜素内酯信号转导的植物特异性转录因子，在植物生长中起着至关重要的作用。今天我就给大家带来一篇甜菜中BZR基因家族分析的文章。文章于2019年5月9日在线发表在BMC Plant Biology（影响因子3.93，中科院分区二区）。具体分析内容如下：一、甜菜中 BvBZR 基因的鉴定通过鉴定，共鉴定出6个BvBZR基因： Bv5_cuzi 、 Bv_epwr 、 Bv1_fxre 、 Bv6_nyuw 、 Bv1_qnjn 、 Bv_yfzt 。二、Motif分析和系统发育分析为了阐明BZR家族的进化关系，作者基于来自甜菜、拟南芥、水稻和大白菜的41个BZR家族成员的氨基酸序列构建了系统发育树，并进行了motif分析。三、 BvBZR 基因染色体分布和基因结构分析作者将鉴定的6个 BvBZR 基因定位到了甜菜基因组的5条染色体上，并对基因结构进行了分析。四、 BvBZR 基因的顺势作用原件分析五、不同甜菜品种根茎的生长特征规律统计作者统计了包括主根的生长曲线（根重）、主根的生长速度、主根的含糖量以及主根含糖量的增加速率4个指标。六、与甜菜生长特征相关的基因表达模式和相关性分析七、 BvBZR 基因在E型和Z型根、茎、叶组织中表达模式分析八、 BvBZR 基因对植物激素响应的基因表达模式分析为了研究 BvBZR 基因的表达水平是否受外源植物激素的调节，作者对甜菜根喷洒了IAA、ABA、MeJA、GA3共4种植物激素，并检测了 BvBZR 基因的表达水平。九、 BvBZR 基因的亚细胞定位作者首先使用Wolf PSORT软件对 BvBZR 基因进行亚细胞定位预测，并采用实验手段对预测结果进行了验证。总结到此为止，这篇基因家族类文章的所有分析就完成了，在内容上还是比较常规的，只是在实验方面补充了因的亚细胞定位实验和一些生长指标，并没有复杂的实验操作和分析内容，值得大多数研究者借鉴！更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章档次，学习链接： WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、 OTU网络图绘制、 cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门到精通必修基础课，学习链接： linux系统使用、 perl入门到精通、 perl语言高级、 R语言画图 7. 医学相关数据挖掘课程，不用做实验也能发文章，学习链接： TCGA-差异基因分析、 GEO芯片数据挖掘、 GSEA富集分析课程、 TCGA临床数据生存分析、 TCGA-转录因子分析、 TCGA-ceRNA调控网络分析 8.其他课程链接：二代测序转录组数据自主分析、 NCBI数据上传、二代测序数据解读。

基因家族分析投稿sci的期刊

很多，举例几个首先是著名的SCI，它并不拒绝基因家族文章的发表；然后是4区的Geome可以相对容易发表

American Journal of Preventive Medicine《美国预防医学杂志》美国ISSN:0749-3797，1984年创刊，全年8期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子3.167。刊载预防医学基础和应用研究论文。涉及的学科包括流行病学、遗传学、营养学、毒理学和社会科学；应用的领域包括卫生管理、传染病防治、职业医学、环境卫生、航空航天医学、老年病、母婴保健、计划生育等。Annales de Génétique《遗传学纪事》法国ISSN:0003-3995,1958年创刊，全年4期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子0.625。法国遗传学会的会刊。刊载遗传学研究论文、技术札记、文摘和消息。Biochimie《生物化学》法国ISSN:0300-9084，1914年创刊，全年12期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子2.461。刊载有关酶学、遗传学、免疫学、微生物学和高分子结构等方面的研究论文及评论。Biomolecular Engineering《生物分子工程》荷兰ISSN:1389-0344，1983年创刊，全年6期，Elsevier Science出版社，SCI、EI收录期刊，SCI 2005年影响因子1.435，2005年EI收录30篇。研究分子生物学、细胞生物学、免疫学、生物化学和遗传学中使用的新技术、材料及器械。刊载研究论文和综论。Cancer Genetics and Cytogenetics《癌遗传学与细胞遗传学》美国ISSN:0165-4608, 1979年创刊，全年16期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子1.640。刊载癌细胞与分子的基础研究论文。反映癌遗传学和细胞遗传学领域的最新研究进展。Current Opinion in Genetics & Development《遗传学与发育新见》英国ISSN: 0959-437X, 1991年创刊，全年6期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子9.361。著名遗传学权威专业性学术期刊，SCI收录期刊最高影响因子100种之一，刊载分子遗传学、疾病遗传学、遗传组织与变异、细胞繁殖、发育模式与机理等方面的研究进展评论。附近期有关学科主要论文索引。Developmental Biology《发育生物学》美国ISSN:0012-1606，1959年创刊，全年24期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子5.234。著名生物学权威专业性学术期刊，从分子、细胞和遗传的水平上研究动植物发育、变异、生长、再生和组织修复的机能。发表论文。European Journal of Medical Genetics《欧洲医学遗传学》ISSN: 1769-7212，2005年创刊，Elsevier Science出版社，主要刊载关于给类人研究和医学遗传学以及基因实验模型方面的论文。European Journal of Pharmacology: Molecular Pharmacology《欧洲药理学杂志：分子药理浙江工业大学图书馆信息咨询部编 Elsevier Science 出版社期刊投稿指南 60学分册》荷兰ISSN:0922-4106，1989年创刊，全年12期，Elsevier Science出版社，刊载分子水平的药理学、药效学、神经系统药理学等方面的研究论文和简报，内容涉及分子神经传递，信号转导机理，蛋白质受体的遗传反应等。Human Immunology《人类免疫学》美国ISSN:0198-8859，1980年创刊，全年12期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子2.467。刊载人类免疫系统和其他脊椎动物模拟系统的研究论文。侧重于组织适应性和免疫遗传学的研究。Infection, Genetics and Evolution《传染、遗传和进化》荷兰ISSN:1567-1348，2001年创刊，全年4期，Elsevier Science出版社。主要刊载遗传学领域，包括疾病等的传染、遗传、进化等方面的论文。Journal of Molecular Biology《分子生物学杂志》英国ISSN:0022-2836，1959年创刊，全年50期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子5.229。刊载原始论文，论述分子生物学的各个方面，涉及基因结构、复制及解译机理、蛋白质、核酸等大分子的结构和性质、细胞和发育生物学、分子遗传学等。Molecular Genetics and Metabolism《分子遗传学与新陈代谢》美国ISSN:1096-7192，1976年创刊，全年12期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子2.678。1998年前刊名为Biochemical and Molecular Medicine，从生物化学和分子生物学角度对人体正常代谢和代谢病进行研究。发表原始论文、短评和简讯。Mutation Research/Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis《突变研究－突变原理与分子结构》荷兰ISSN:1388-2112，1964年创刊，Elsevier Science出版社。主要刊载关于包括遗传变异基因的作用，并体现突变，可变化合物的代谢方式到以不同的身份和修复受损DNA的细胞复制等方面的论文。Mutation Research/Genetic Toxicology《突变研究—遗传毒理学》ISSN: 0165-1218，Elsevier Science出版社，主要刊载化学物质的遗传毒性测试，以及对人类群体的遗传毒性效应、发育、进化的监督，监控等方面方面的文章。Mutation Research/Genetic Toxicology《突变研究—遗传毒理学》ISSN: 0165-1218，Elsevier Science出版社，主要刊载化学物质的遗传毒性测试，以及对人类群体的遗传毒性效应、发育、进化的监督，监控等方面方面的文章。Mutation Research/Reviews in Mutation Research《突变研究－突变研究评论》荷兰ISSN:1383-5742，1964年创刊，全年6期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子5.333。主要刊载突变和疾病的关系，涵盖人类基因组研究进展(包括演变和功能基因突变检测技术)与临床应用遗传学、基因治疗、环境健康风险评估，遗传毒理学和环境突变(包括遗传因素调节活性剂环境)等方面的论文。Trends in Genetics《遗传学趋势》英国ISSN:0168-9525，1985年创刊，全年12期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子12.047。权威专业性学术期刊，SCI收录期刊最高影响因子100种之一，刊载分子遗传学、变异、发育方面的评论、札记和书评，涉及临床遗传学、遗传学与社会、应用技术与人口遗传学等问题。

因子分析论文发表

可以。因子分析是指研究从变量群中提取共性因子的统计技术。最早由英国心理学家C.E.斯皮尔曼提出。他发现学生的各科成绩之间存在着一定的相关性，一科成绩好的学生，往往其他各科成绩也比较好，从而推想是否存在某些潜在的共性因子，或称某些一般智力条件影响着学生的学习成绩。因子分析可在许多变量中找出隐藏的具有代表性的因子。将相同本质的变量归入一个因子，可减少变量的数目，还可检验变量间关系的假设。

将分析题项拖入选框中，点击进行“开始因子分析”（用户可主动设置因子个数）。因子分析（探索性因子分析）用于探索分析项应该分成几个因子，比如20个量表题项应该分成几个方面较为合适。因子分析通常有三个步骤：第一步是判断是否适合进行因子分析；第二步是因子与题项对应关系判断；第三步是因子命名。因子分析应用举例：1、案例当前有一份数据，共有12个量表题，希望将此12个量表题使用因子分析浓缩成几个维度，用于探索企业员工满意度的维度情况。研究人员在研究前预期分析项可分为4个维度（也可不事先假定），当然有可能个别项与因子对应关系并不合适，因此有可能对其进行删除处理。2、操作步骤将分析题项拖入选框中，点击进行“开始因子分析”（用户可主动设置因子个数）得到的分析结果如下：第一步：首先判断是否适合进行因子分析KMO和Bartlett检验结果SPSSAU对结果进行智能分析第二步：判断提取的因子个数第三步：是因子与题项对应关系判断因子与题项对应关系判断：假设预期为4个因子(变量)，分析题项为12个；因子与题项交叉共得到48个数字，此数字称作”因子载荷系数”(因子载荷系数值表示分析项与因子之间的相关程度)；针对每个因子(变量)，对应12个”因子载荷系数”，针对每个分析项，则有4个”因子载荷系数值”(比如0.765,-0.066,0.093,0.075)，选出3个数字绝对值大于0.4的那个值(0.765),如果其对应因子1,则说明此题项应该划分在因子1下面。第四步：对因子进行命名本次研究员工满意量表共提取出4个因子，此4个因子对应的题项分别为4个、3个和2个，对4个因子分别进行命名，分别为福利待遇因子、管理及制度因子、员工自主性因子和工作性质因子。