《南京农业大学学报》创刊于1956年9月，是经中共江苏省委文化教育部批准，由中华人民共和国教育部主管，南京农业大学主办的综合性农业学术期刊。据2018年11月《南京农业大学学报》官网显示，《南京农业大学学报》
学校的学报(自然科学版、哲学社会科学版)向国内外公开发行，还编辑出版了《林业经济问题》、《亚热带农业研究》、《武夷科学》、《华东昆虫学报》、《高教理论与实践》等刊物。学校先后获得“全国精神文明建设工作先进单位”
S 综合性农业科学 1. 中国农业科学 2. 南京农业大学学报 3. 华北农学报 4. 西北农林科技大学学报.自然科学版 5. 华中农业大学学报6. 中国农业大学学报 7. 福建农林大学学报.自然科学版 8. 浙江大学学报.
东北林业大学学报 东北农业大学学报 东北农业大学学报(英文版) 动物医学进展 防护林科技 分子植物育种 福建茶叶 福建稻麦科技 福建果树 福建林学院学报 福建林业科技 福建农机 福建农林大学学报(自然科学版)
学报期刊 学校主要出版有《福建农林大学学报(哲学社会科学版)》、《福建农林大学学报(自然科学版)》、《林学院学报》、《生物安全学报》、《林业经济问题》、《亚热带农业研究》、《武夷科学》7种学术期刊。
30 大豆科学A 31 河南农业大学学报A 32 棉花学报A 33 吉林农业大学学报A 34 农业生物技术学报A 35 中国油料作物学报A 36 福建农林大学学报(自然科学版) A 37 新疆农业科学A 38 云南农业大学学报A 39 核农学报A 40
经审核同意后一般在收到稿件后3个月内出版。要求刊印彩图者需另付彩图印制工本费。稿件刊登后酌致稿酬(已含其他形式出版稿酬)，赠当期杂志1册。
2009, 27 (4): 369－374.马英，关瑞章，汪琳，等. 九孔鲍 苗期养殖水体细菌的群落结构。福建农林大学学报（自然科学版），2009，38（5）：526－531.马英，熊何健，林源洪，等. 外来海洋物种入侵风险评估体系的构建。
本刊自创刊以来，取得了较大的发展，影响力也不断扩大。2008年本刊影响因子为0.718,跃居全国农林医药院校社科学报第1名；2009年获RCCSE中国核心学术期刊（2009-2010），也成为《中文社会科学引文索引（CSSCI）》
华南农业大学学报 12. 植物营养与肥料学报 6. 安徽农业大学学报 24. 湖北农业科学 33.自然科学版28. 福建农林大学学报.玉米科学5. 中国农机化 S3. 浙江农业学报 29. 四川农业大学学报 23. 土壤学报 2.
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