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已在《政治学研究》、《马克思主义研究》等刊物发表论文80余篇，2000年以来有代表性的论文：1. 《市场经济体制建立与完善进程中的地方政府治理变革》，《政治学研究》2009年2期 CN11-1396/D2.《政治交易的经济分析》，《厦门大学学报》（哲学社会科学版）2009年5期CN35-1019/C3.《中国公共管理理论研究的进展——近十年研究的评述》，《东南学术》2009年5期CN35-1197/C4. 《论决策的政治本质对政策选择的影响》，《财经问题研究》2008年8期 CN21-1096/F5．《论政府社会性规制职能的完善》，《政治学研究》2007年2期 CN11-1396/D6．《政治发展中影响政治稳定的因素探析》，《政治学研究》2006年2 CN11-1396/D7．《当代意识形态研究》，《政治学研究》2003年3期 CN11-1396/D8．《政治科学中的新制度主义》，《厦门大学学报》（哲学社会科学版）2005年3期 CN35-1019/C9．《国家统一或分裂的决定因素：新政治经济学的分析》，《财经问题研究》2007年10期 CN21-1096/F10．《政府管制、公共企业和特许经营权竞标》，《东南学术》2006年1期CN34-1197/C11．《发展的政治经济学理论》，《天津社会科学》2006年3期 CN12-1047/C12．《当代西方新政治经济学的兴起》，《天津社会科学》2005年1期 CN12-1047/C13．《新政治经济学视野中的经济改革与转轨》，《财经问题研究》2005年5期 CN21-1096/F14．《放松规制与激励规制》，《云南民族大学学报》（哲学社会科学版）2004年 CN53-1191/C年5期 CN11-162715. 《略论当代西方国家公共行政改革及其借鉴意义》，《社会主义研究》2001年5期 CN42-1093/D16. 《诺夫“可行的社会主经济模式”探析》，《马克思主义研究》2000年2期 CN11-3591/C17. 《新制度经济学的国家理论探析》，《厦门大学学报》（哲社版）2000年1期 CN35-1019/C18. 《制度变迁中国家作用的经济学分析》，《西南师范大学学报》（人文社会科学版）2000年6期 CN51-1098/C19．《制度缺失与中国经济体制改革面临的三大问题》，《财经问题研究》2003年8期 CN21-1096/F20. 《中国经济体制改革实现制度转型的原因探析》，《西南师范大学学报》（人文社会科学版）2002年3期 CN50-1022/C21. 《试论中国经济体制改革时期制度缺失的表现》，《财贸研究》，2002年3期 CN34-1093/F22. 《中国经济体制改革时期制度变迁的特征分析》，《财经问题研究》2002年1期 CN21-1096/F
1. Sanwen Huang*, Zhonghua Zhang, XingfangGu,…, Jun Wang, Songgang Li. The genome of the cucumber (Cucumis sativus L.). Nature Genetics2009, 41:1275-1281 (*Corresponding author)2. The Potato Genome Sequencing Consortium. Genome sequence and analysis of the tuber crop potato. Nature2011, 475: 189-195 (*Sanwen Huang, Corresponding author)3. The Tomato Genome Consortium. The tomato genome sequence provides insights into fleshy fruit evolution. Nature2012,485(7400):635-641. (*Sanwen Huang, Principal investigator)4. ShaoguiGuo, et al., The draft genome of watermelon (Citrulluslanatus) and resequencing of 20 diverse accessions.Nature Genetics. 2012, doi:10.1038/ng.2470. (*Sanwen Huang, Consortium organizer)5. The Brassica rapa Genome Sequencing Project Consortium. The genome of the mesopolyploid crop species Brassica rapa.Nature Genetics. 2011, 43(10): 1035-1039. (*Principal investigator)6. Guangcun Li, Sanwen Huang*, Xiao Guo, Ying Li, Yu Yang, Zhen Guo, Hanhui Kuang, Hendrik Rietman, Marjan Bergervoet, Vivianne Vleeshouwers, Edwin van der Vossen, Richard Visser, Evert Jacobsen, Jack Vossen. Cloning and characterization of R3b; Members of the R3 superfamily of late blight resistance genes show sequence and functional divergence. Molecular Plant-Microbe Interactions 2011, 42 (10): 1132-1142（*co-first authors）7. Yonghua Han, Zhonghua Zhang, Chunxia Liu, Jinhua Liu, Sanwen Huang, Jiming Jiang, Weiwei Jin. Centromere repositioning in cucurbit species: Implication of the genomic impact from centromere activation and inactivation. PNAS.2009, 106(35):14937-418. Zheng Li*, Sanwen Huang*, Shiqiang Liu, Junsong Pan, Zhonghua Zhang, Qianyi Tao, Qiuxiang Shi, ZhiqiJia, Weiwei Zhang, Huiming Chen, Longting Si, Lihuang Zhu, Run Cai. Molecular isolation of the M gene suggests a conserved residue conversion may cause a functional alteration leading to the display of a new phenotype in cucumber plants. Genetics2009;182(4):1381-5（*co-first authors）9. Yi Ren, Zhonghua Zhang, Jinhua Liu, Jack E. Staub, Yonghua Han, Xuefeng Li, Jingyuan Lu, Han Miao, BingyanXie, XingfangGu, Yongchen Du, Weiwei Jin*, Sanwen Huang*. Integrated genetic and cytogenetic map of the cucumber genome. PLoS One. 2009,4(6):5795. (*corresponding authors)10. Miles R. Armstrong, Stephen C. Whisson, Leighton Pritchard, …,Sanwen Huang, Sophien Kamoun, Jim L. Beynon, and Paul R. J. Birch. An ancestral oomycete locus contains late blight avirulence gene Avr3a, encoding a protein that is recognized in the host cytoplasm. PNAS2005 102 (21): 7766-7771.11. Sanwen Huang, Edwin A.G. van der Vossen, Hanhui Kuang, Vivianne G.A.A. Vleeshouwers, Ningwen Zhang, Theo J.A. Borm, Herman J. van Eck, Barbara Baker, Evert Jacobsen and Richard G.F. Visser. Comparative genomics enabled the isolation of the R3a late blight resistance gene in potato. Plant Journal2005 42(2): 261-271.12. Sanwen Huang*, Vleeshouwers, VGAA, Werij JS, Hutten RCB, van Eck HJ, Visser RGF, and Jacobsen E. The R3 resistance to Phytophthorainfestans in potato is conferred by two closely linked R genes with distinct specificities. Molecular Plant-Microbe Interactions2004, 17: 4, 428-435. (corresponding author)
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