发表论文后申请软件著作权
软件著作权又称为计算机软件著作权是指软件的开发者或者其他权利人依据 有关著作权法律的规定，对于软件作品所享有的各项专有 权利。就权利的性质而言，它属于一种民事权利，具备民事权利的共同特征。
著作权是知识产权中的例外，因为著作权的取得无须经过个别确认，这就是人们常说的"自动保护"原则。软件经过登记后，软件著作权人享有发表权、开发者身份权、使用权、使用许可权和获得报酬权。
根据相关政策规定，软件著作权的审批机构审批部门为：国家 版权中心软件著作权期限：50年
申请软件著作权的流程如下：
1、准备并提交申请报告及要求的全部材料2、等待中国版权中心审核3、材料问题退回（90%几率发生）4、重新准备并提交5、向申请者发出受理通知书6、材料送往相关部门审查7、受理是否通过裁决8、批准申请9、领取许可证书
证书案例：
第一章 总则第一条 为贯彻《计算机软件保护条例》（以下简称《条例》）制定本办法。第二条 为促进我国软件产业发展，增强我国信息产业的创新能力和竞争能力，国家著作权行政管理部门鼓励软件登记，并对登记的软件予以重点保护。第三条 本办法适用于软件著作权登记、软件著作权专有许可合同和转让合同登记。第四条 软件著作权登记申请人应当是该软件的著作权人以及通过继承、受让或者承受软件著作权的自然人、法人或者其他组织。软件著作权合同登记的申请人，应当是软件著作权专有许可合同或者转让合同的当事人。第五条 申请人或者申请人之一为外国人、无国籍人的，适用本办法。第六条 国家版权局主管全国软件著作权登记管理工作。国家版权局认定中国版权保护中心为软件登记机构。经国家版权局批准，中国版权保护中心可以在地方设立软件登记办事机构。第二章 登记申请第七条 申请登记的软件应是独立开发的，或者经原著作权人许可对原有软件修改后形成的在功能或者性能方面有重要改进的软件。第八条 合作开发的软件进行著作权登记的，可以由全体著作权人协商确定一名著作权人作为代表办理。著作权人协商不一致的，任何著作权人均可在不损害其他著作权人利益的前提下申请登记，但应当注明其他著作权人。第九条 申请软件著作权登记的，应当向中国版权保护中心提交以下材料：（一）按要求填写的软件著作权登记申请表；（二）软件的鉴别材料；（三）相关的证明文件。第十条 软件的鉴别材料包括程序和文档的鉴别材料。程序和文档的鉴别材料应当由源程序和任何一种文档前、后各连续30页组成。整个程序和文档不到60页的，应当提交整个源程序和文档。除特定情况外，程序每页不少于50行，文档每页不少于30行。第十一条 申请软件著作权登记的，应当提交以下主要证明文件：（一）自然人、法人或者其他组织的身份证明；（二）有著作权归属书面合同或者项目任务书的，应当提交合同或者项目任务书；（三）经原软件著作权人许可，在原有软件上开发的软件，应当提交原著作权人的许可证明；（四）权利继承人、受让人或者承受人，提交权利继承、受让或者承受的证明。第十二条 申请软件著作权登记的，可以选择以下方式之一对鉴别材料作例外交存：（一）源程序的前、后各连续的30页，其中的机密部分用黑色宽斜线覆盖，但覆盖部分不得超过交存源程序的50%；（二）源程序连续的前10页，加上源程序的任何部分的连续的50页；（三）目标程序的前、后各连续的30页，加上源程序的任何部分的连续的20页。文档作例外交存的，参照前款规定处理。第十三条 软件著作权登记时，申请人可以申请将源程序、文档或者样品进行封存。除申请人或者司法机关外，任何人不得启封。第十四条 软件著作权转让合同或者专有许可合同当事人可以向中国版权保护中心申请合同登记。申请合同登记时，应当提交以下材料：（一）按要求填写的合同登记表；（二）合同复印件；（三）申请人身份证明。第十五条 申请人在登记申请批准之前，可以随时请求撤回申请。第十六条 软件著作权登记人或者合同登记人可以对已经登记的事项作变更或者补充。申请登记变更或者补充时，申请人应当提交以下材料：（一）按照要求填写的变更或者补充申请表；（二）登记证书或者证明的复印件；（三）有关变更或者补充的材料。第十七条 登记申请应当使用中国版权保护中心制定的统一表格，并由申请人盖章（签名）。申请表格应当使用中文填写。提交的各种证件和证明文件是外文的，应当附中文译本。申请登记的文件应当使用国际标准A4型297mm X 210mm（长X宽）纸张。第十八条 申请文件可以直接递交或者挂号邮寄。申请人提交有关申请文件时，应当注明申请人、软件的名称，有受理号或登记号的，应当注明受理号或登记号。第三章 审查和批准第十九条 对于本办法第九条和第十四条所指的申请，以收到符合本办法第二章规定的材料之日为受理日，并书面通知申请人。第二十条 中国版权保护中心应当自受理日起60日内审查完成所受理的申请，申请符合《条例》和本办法规定的，予以登记，发给相应的登记证书，并予以公告。第二十一条 有下列情况之一的，不予登记并书面通知申请人：（一)表格内容填写不完整、不规范，且未在指定期限内补正的；（二）提交的鉴别材料不是《条例》规定的软件程序和文档的；（三）申请文件中出现的软件名称、权利人署名不一致，且未提交证明文件的；（四）申请登记的软件存在权属争议的。第二十二条 中国版权保护中心要求申请人补正其他登记材料的，申请人应当在30日内补正，逾期未补正的，视为撤回申请。第二十三条 国家版权局根据下列情况之一，可以撤销登记：（一）最终的司法判决；（二）著作权行政管理部门作出的行政处罚决定。第二十四条 中国版权保护中心可以根据申请人的申请，撤销登记。第二十五条 登记证书遗失或损坏的，可申请补发或换发。第四章 软件登记公告第二十六条 除本办法另有规定外，任何人均可查阅软件登记公告以及可公开的有关登记文件。第二十七条 软件登记公告的内容如下：（一）软件著作权的登记；（二）软件著作权合同登记事项；（三）软件登记的撤销；（四）其他事项。第五章 费用第二十八条 申请软件登记或者办理其他事项，应当交纳下列费用：（一）软件著作权登记费；（二）软件著作权合同登记费；（三）变更或补充登记费；（四）登记证书费；（五）封存保管费；（六）例外交存费；（七）查询费；（八）撤销登记申请费；（九）其他需交纳的费用。具体收费标准由国家版权局会同国务院价格主管部门规定并公布。第二十九条 申请人自动撤回申请或者登记机关不予登记的，所交费用不予退回。第三十条 本办法第二十八条规定的各种费用，可以通过邮局或银行汇付，也可以直接向中国版权保护中心交纳。第六章 附则第三十一条 本办法规定的、中国版权保护中心指定的各种期限，第一日不计算在内。期限以年或者月计算的，以最后一个月的相应日为届满日；该月无相应日的，以该月的最后一日为届满日。届满日是法定节假日的，以节假日后的第一个工作日为届满日。第三十二条 申请人向中国版权保护中心邮寄的各种文件，以寄出的邮戳日为递交日。信封上寄出的邮戳日不清晰的，除申请人提出证明外，以收到日为递交日。中国版权保护中心邮寄的各种文件，送达地是省会、自治区首府及直辖市的，自文件发出之日满十五日，其他地区满二十一日，推定为收件人收到文件之日。第三十三条 申请人因不可抗力或其他正当理由，延误了本办法规定或者中国版权保护中心指定的期限，在障碍消除后三十日内，可以请求顺延期限。第三十四条 本办法由国家版权局负责解释和补充修订。第三十五条 本办法自发布之日起实施。
一、计算机软件著作权登记指南
1、费用：申请计算机软件著作权需要支付0元官费；注释：软件著作权登记费包括：软件著作权登记申请费（含申请例外交存手续费）；软件著作权登记证书费；软件著作权合同登记费；变更或补充登记费；软件源程序封存保管费
2、申请材料：申请人请求计算机软件著作权，需要提供营业执照复印件加盖单位公章，或者是个人身份复印件。
3、计算机软件著作权申请时间 ：申请版权需要的时间是30个工作日左右；
4、独立开发完成软件的自然人、法人或其他组织以及通过合同约定、继承、受让或者承受软件著作权的自然人、法人或者其他组织都可以成为著作权人。；
5、申请人计算机软件著作权需要符合一定的要求，否则会被驳回。
6、申请条件：著作权人是多方的软件，可以申请要多个证书，其中一个为正本，其余的是副本。证书的正本和副本数额不能超过著作权人的数量。。
7、申请部门：在我国计算机软件著作权所属部门是中国版权保护中心。
二、计算机软件著作权常见问题及注意事项
计算机软件是指计算机程序及其有关文档。计算机程序是指能实现一定功能的代码化指令序列，或者符号化语句序列。文档指用来描述程序的内容、组成、设计、功能规格、开发情况、测试结果及使用方法的文字资料和图表，如程序设计说明书、流程图、用户手册等。
三、软件著作权保护期限是多长
自然人的软件著作权，保护期为自然人终生及其死亡后50年；软件是合作开发的，截止于最后死亡的自然人死亡后第50年的12月31日。法人或者其他组织的软件著作权，保护期为软件首次发表之后50年，但软件自开发完成之日起50年内未发表的，不再保护。
发表了论文还能申请软件著作权吗
软件的著作权是指对程序代码的法律保护权，当软件制作者在程序的设计、编写过程中，产生了使用版权保护的软件，就应该向国家知识产权局申请软件著作权。发表过的软件同样可以申请著作权，只要软件含有独创性、创意性和能够被知识产权法保护的特点，并经过申请程序的审核，就可以获得软件的著作权保护，以确保软件制作者的合法权益和利益。
先申请软著后发表论文
由于申请专利的技术具有新颖性，因此发明人有了技术成果之后，应首先申请专利，再发表论文，以免因发表论文过早公开技术而失去新颖性，丧失申请专利的机会。具备新颖性、创造性和实用性是取得专利权的实质条件。
专利申请后发表论文不会破坏专利的新颖性，因此可以发表论文。一定不能在论文发表后申请专利。
软件著作权是证明文件 不会和发表论文起冲突 不过我建议还是和著作权人沟通一下
发表论文软件著作权
论文是属于知识产权的，论文作者对论文享有著作权。论文著作权实行自愿登记，论文不论是否登记，作者或其他著作权人依法取得的著作权不受影响。我国实行作品自愿登记制度的在于维护作者或其他著作权人和作品使用者的合法权益，有助于解决因著作权归属造成的著作权纠纷，并为解决著作权纠纷提供初步证据。一、我国《著作权法》明确规定了不予保护的对象。本法不适用于：（一）法律、法规，国家机关的决议、决定、命令和其他具有立法、行政、司法性质的文件，及其官方正式译文；（二）单纯事实消息；（三）历法、通用数表、通用表格和公式。二、我国《著作权法》规定的合理使用情形有：（1）为个人学习、研究或者欣赏，使用他人已经发表的作品；（2）为介绍、评论某一作品或者说明某一问题，在作品中适当引用他人已经发表的作品；（3）为报道新闻，在报纸、期刊、广播电台、电视台等媒体中不可避免地再现或者引用已经发表的作品；（4）报纸、期刊、广播电台、电视台等媒体刊登或者播放其他报纸、期刊、广播电台、电视台等媒体已经发表的关于政治、经济、宗教问题的时事性文章，但著作权人声明不许刊登、播放的除外；（5）报纸、期刊、广播电台、电视台等媒体刊登或者播放在公众集会上发表的讲话，但作者声明不许刊登、播放的除外；（6）为学校课堂教学或者科学研究，翻译、改编、汇编、播放或者少量复制已经发表的作品，供教学或者科研人员使用，但不得出版发行；（7）国家机关为执行公务在合理范围内使用已经发表的作品；（8）图书馆、档案馆、纪念馆、博物馆、美术馆、文化馆等为陈列或者保存版本的需要，复制本馆收藏的作品；（9）免费表演已经发表的作品，该表演未向公众收取费用，也未向表演者支付报酬，且不以营利为目的；（10）对设置或者陈列在公共场所的艺术作品进行临摹、绘画、摄影、录像；（11）将中国公民、法人或者非法人组织已经发表的以国家通用语言文字创作的作品翻译成少数民族语言文字作品在国内出版发行；（12）以阅读障碍者能够感知的无障碍方式向其提供已经发表的作品；（13）法律、行政法规规定的其他情形。三、除承担民事责任，行为严重的，还可能需要承担行政责任甚至刑事责任的侵权行为：1.未经著作权人许可，复制、发行、表演、放映、广播、汇编、通过信息网络向公众传播其作品的，本法另有规定的除外；2.出版他人享有专有出版权的图书的；3.未经表演者许可，复制、发行录有其表演的录音录像制品，或者通过信息网络向公众传播其表演的，本法另有规定的除外；4.未经录音录像制作者许可，复制、发行、通过信息网络向公众传播其制作的录音录像制品的，本法另有规定的除外；5.未经许可，播放、复制或者通过信息网络向公众传播广播、电视的，本法另有规定的除外；6.未经著作权人或者与著作权有关的权利人许可，故意避开或者破坏技术措施的，故意制造、进口或者向他人提供主要用于避开、破坏技术措施的装置或者部件的，或者故意为他人避开或者破坏技术措施提供技术服务的，法律、行政法规另有规定的除外；7.未经著作权人或者与著作权有关的权利人许可，故意删除或者改变作品、版式设计、表演、录音录像制品或者广播、电视上的权利管理信息的，知道或者应当知道作品、版式设计、表演、录音录像制品或者广播、电视上的权利管理信息未经许可被删除或者改变，仍然向公众提供的，法律、行政法规另有规定的除外；8.制作、出售假冒他人署名的作品的。法律依据：《中华人民共和国著作权法》第二条中国公民、法人或者其他组织的作品，不论是否发表，依照本法享有著作权。外国人、无国籍人的作品根据其作者所属国或者经常居住地国同中国签订的协议或者共同参加的国际条约享有的著作权，受本法保护。
法律分析：有用，评职称需要有发表的论文或者作品，软件著作权算其中之一。如果拥有软件著作权的话，对于评职称是有用的， 职称软著加分 的。有的单位对于评职称是有一定条件的，有的就要求有软件著作权。.所以说，如果单位有要求的话，那么评职称时必须要有软件著作权的，这样评职称才有效。
法律依据：根据《计算机软件保护条例》第第八条规定： 软件著作权人享有下列各项权利：(一)发表权，即决定软件是否公之于众的权利;(二)署名权，即表明开发者身份，在软件上署名的权利;(三)修改权，即对软件进行增补、删节，或者改变指令、语句顺序的权利;(四)复制权，即将软件制作一份或者多份的权利;(五)发行权，即以出售或者赠与方式向公众提供软件的原件或者复制件的权利;(六)出租权，即有偿许可他人临时使用软件的权利，但是软件不是出租的主要标的的除外;(七)信息网络传播权，即以有线或者无线方式向公众提供软件，使公众可以在其个人选定的时间和地点获得软件的权利;(八)翻译权，即将原软件从一种自然语言文字转换成另一种自然语言文字的权利;(九)应当由软件著作权人享有的其他权利。软件著作权人可以许可他人行使其软件著作权，并有权获得报酬。软件著作权人可以全部或者部分转让其软件著作权，并有权获得报酬。
软件著作权发表论文
软著对评副高级职称的作用如下：
评职称需要有发表的论文或者作品，软件著作权算其中之一。如果拥有软件著作权的话，对于评职称是有用的， 职称软著加分 的。有的单位对于评职称是有一定条件的，有的就要求有软件著作权。.所以说，如果单位有要求的话，那么评职称时必须要有软件著作权的，这样评职称才有效。
法律依据：根据《计算机软件保护条例》第第八条规定： 软件著作权人享有下列各项权利：发表权，即决定软件是否公之于众的权利;署名权，即表明开发者身份，在软件上署名的权利;修改权，即对软件进行增补、删节，或者改变指令、语句顺序的权利;复制权，即将软件制作一份或者多份的权利;发行权，即以出售或者赠与方式向公众提供软件的原件或者复制件的权利;
出租权，即有偿许可他人临时使用软件的权利，但是软件不是出租的主要标的的除外;信息网络传播权，即以有线或者无线方式向公众提供软件，使公众可以在其个人选定的时间和地点获得软件的权利;翻译权，即将原软件从一种自然语言文字转换成另一种自然语言文字的权利;
应当由软件著作权人享有的其他权利。软件著作权人可以许可他人行使其软件著作权，并有权获得报酬。软件著作权人可以全部或者部分转让其软件著作权，并有权获得报酬。
2006年，为提高我国深海油气勘探开发能力，形成深水海洋油气勘探开发产业链，提升我国海洋油气产业参与国际竞争的能力，推动我国装备制造业向深水高端领域进军，实现我国深海油气勘探开发技术实现跨越式发展，“863”计划海洋技术领域办公室在广泛、深入的战略研究和需求分析的基础上，启动了“南海深水油气资源勘探开发关键技术和装备”重大项目。项目累计投入国拨经费2.43亿元，各承担单位配套投入研发经费4.05亿元，该项目组织吸引了国土资源部、教育部、国家海洋局、中国石油集团、中国海油集团、中国石化集团、中船重工集团等部门和大型集团公司所属工程、技术研究单位、研究院所、高校累计104家单位参与攻关，参与项目研发任务的研究人员达到1690人。该项目申请专利286项，其中发明专利149项，获得授权专利154项，发明专利45项；获得软件著作权登记65项，发表论文931篇，出版专著6部；制定国家、行业技术标准10项，建立了2个研究基地；培养了一大批我国急需的深水油气勘探开发领域的高层次人才，包括培养博士207人、硕士396人、试验设计、工程的领军人才近百人。项目成果为南海第一批4口深水油气探井及5万多公里深水油气综合地球物理勘探作业提供了技术支持。“十二五”期间“863”计划海洋技术领域在“十一五”期间“南海深水油气勘探开发关键技术及装备”项目研发成果的基础上，已启动“深水油气勘探开发关键技术及装备”重大项目，计划投入国拨经费4.5亿元。该项目将以企业为课题牵头单位，进一步攻克系列核心关键技术，推动一批重大装备实现产业化，以期为维护我国海洋权益，推动我国油气工业走向深水和海外提供强有力的技术和装备支撑。“南海深水油气勘探开发关键技术及装备”重大项目重点在深水油气资源勘探、钻完井、海洋工程和安全保障三个方面开展关键技术研究，完成了深水半潜式钻井平台和深水铺管系统设计建造技术的研发，为我国第一艘深水半潜式钻井平台“海洋石油981”和第一艘深水铺管船“海洋石油201”等重大装备提供了技术支撑；自主研制了我国第一套海上高精度地震勘探技术装备，初步形成了适用于南海的深水油气盆地综合地球物理勘探评价技术；研制了深水防喷器、深水钻井隔水管、深水水下井口头等深水核心装备工程样机；研发了具有我国自主知识产权的深水井身结构设计、表层钻井、井控、钻井液、固井、完井测试等关键技术，并成功应用于南海深水油气勘探开发工程；构建了深水油气工程的公共试验平台，具备4000m深水海洋工程试验的能力，新型平台的设计技术和灾害海洋环境下平台安全性评估技术等取得了重要的进展。这些成果初步形成了3000m水深深水油气勘探开发技术能力，为我国实现水深300～3000m的深水油气田的勘探开发提供了技术支撑。