这句话的毛病属于把两个风马牛不相及的事情放在了一起，难以构成转折关系。另外语序有不当的地方。修改后的句子可以这样的：这所学校虽然看起来不怎么起眼，但是曾在级论文比赛中获得两次大奖。
这所学校不但在论文比赛中获得两次级大奖。
这句话的毛病属于把两个风马牛不相及的事情放在了一起，难以构成转折关系。另外语序有不当的地方。修改后的句子可以这样的：这所学校虽然看起来不怎么起眼，但是曾在级论文比赛中获得两次大奖。
这所学校不但在论文比赛中获得两次级大奖。