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1985年，我校改为安徽医科大学，该刊更名为《安徽医科大学学报》，徐叔云同志任编委会主任委员。1988年报刊重新登记，该刊国内统一刊号：CN34-1065,主编为龚西瑜同志。1989年7月增补黄河胜同志为编辑部副主任。1990年12月，
30. 广西医科大学学报 31. 山东医药 32. 河南医科大学学报（改名为：郑州大学学报.医学版）33. 哈尔滨医科大学学报 34. 安徽医科大学学报 35. 北京医学 36. 医学与哲学 预防医学、卫生学类核心期刊表 === 1
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编辑出版的国家级及面向全国发行的期刊有《安徽医科大学学报》、《中国药理学通报》、《临床与实验病理学杂志》、《中华疾病控制杂志》等15种。学校藏书86万余册，中外文印刷期刊及网络电子版期刊30余万册，
《安徽医科大学学报》是安徽医科大学主办的医学综合类学术期刊。主要刊登医学科研、医疗成果和进展的学术性期刊，国内外公开发行。主办单位为安徽医科大学，主管单位为安徽省教育厅。主编是著名妇产科学和生殖医学专家曹云霞教授。
编辑出版的国家级及面向全国发行的期刊有《安徽医科大学学报》、《中国药理学通报》、《临床与实验病理学杂志》、《疾病控制杂志》等15种。学校与欧、美、日本、加拿大等地区和国家的一些著名高校建立了密切的校际关系。
1 《安徽医科大学学报》是公开发行的综合性医学学术期刊。1955年创刊,月刊。为《中文核心期刊要目总览》2004、2008、2011年版收录的综合性医药卫生类核心期刊（中国科技论文统计源期刊），2009、2010、2011年RCCSE
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